Зона санітарної охорони поділяється на дві-три підзони. Перша підзона – строгого режиму з огородженнями, а інколи зі спеціальною охороною. Ця зона обсаджується лісовими насадженнями, тут забороняється будувати, випасати худобу, будь-який вид діяльності, котрий може зумовити забруднення води.
Друга підзона має обмеження за видами діяльності, що спричиняють забруднення, здатні проникнути у водозабір; у ній забороняється розташовувати склади паливно-мастильних матеріалів, тваринницькі ферми, застосовувати добрива.
Третя підзона – попереджувальна. У ній також обмежуються види діяльності, що викликають забруднення води.
